L'établissement propose des formations de la seconde au BTSA et classes préparatoires aux grandes écoles dans les domaines de la biologie-écologie, l'aménagement, l'environnement, l'agriculture et le machinisme agricole.

Le lycée prépare au Baccalauréat Professionnel agroéquipement, au baccalauréat sciences et technologies de l'agronomie et du vivant (STAV option PA ou AVE) et au baccalauréat scientifique S option EAT. Le Chesnoy propose aussi deux filières de BTSA en Génie des Équipement Agricole (GDEA) et Analyse, Conduite et Stratégie de l' Entreprise agricole (ACSE).

Une des particularités du lycée est la présence de deux filières de classes préparatoires aux grandes écoles CPGE Technologie Biologie (TB) et CPGE Biologie Chimie Physique Sciences de la terre (BCPST). Ces 2 classes CPGE préparent aux concours d'entrée aux écoles vétérinaires, écoles d'ingénieurs agronomes, AgroParitech. . . .

- classe préparatoire, CPGE BCPST destinée aux étudiants issus du baccalauréat scientifique
- classe préparatoire, CPGE TB destinée aux étudiants issus des baccalauréats technologiques STAV et STL Biotechnologies ou SPCL.